Machu Picchu est harmonieusement insérée dans un lieu de rencontre de la montagne et de la forêt tropicale, sur une superficie plane au sommet de la cime, difficilement accessible et entourée d'un précipice se jetant dans le fleuve Urumbamba, aux virages sinueux et rapides, 400 mètres plus bas.
Machu Picchu est divisée en deux grands secteurs - agraire et urbain - aux architectures différenciées en raison des fonctions.
Le secteur agraire se caractérise par des cultures en terrasses, reliées entre elles par des escaliers de pierre adossés aux murs.
Le secteur urbain comprend une énorme place entourée par deux groupes de construction aux chemins en escalier atteignant les 3000 marches, un système très complexe de canaux hydrauliques, des places et points d'accès. Les constructions sont de forme rectangulaire sur un étage, respectant toute un design commun.
La grande Citadelle de Machu Picchu est construite en pierre. Ses énormes murailles, terrasses et rampes paraissent taillées en roche continue. Elle est probablement la création urbaine la plus impressionnant de l'Empire Inca, témoin jusqu'à aujourd'hui de l'habilité architectonique des Incas.
Presque toutes les pierres sont de granite venant des zones avoisinantes. Leur forme et taille sont fruit de la technique inca de coupage de pierre, elles furent probablement poncées au sable. Pour des différentes raisons, on pensait initialement que les murs étaient couverts d'argile.
Les blocs s'encaissent les uns dans les autres avec une telle perfection, résultat d'études complexes, tel un puzzle difficile ou une planification de construction minutieuse. L'achèvement des parois de Machu Picchu supère toute imagination, donnant lieu à des explications mystiques. Nous pouvons affirmer avec certitude que les vestiges datent de la période de l'apogée de la culture inca (1438-1532).
L'importance de la Citadelle de Machu Picchu pour le Tahuantinsuyo est évidente.
Densément peuplée pendant ses époques, Machu Picchu est la principale de toutes les constructions incas, résultat d'une planification extraordinaire, reliées entre elles à la ville de Cusco par des sentiers de pierre, les fameux Chemins de l'Inca.
La capacité productive fait partie de l'importance de la région, car la majorité des sites archéologiques sont des complexes agricoles de grande magnitude. Vu l'entourage de Machu Picchu, le mais, la pomme de terre et peut être la coca devaient être les produits agricoles privilégiés.