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El sector agrícola ocupa toda la parte sur oriental de la ciudadela. Presenta una sucesión de andenes de diferente tipo y dimensión construidas en las laderas de las montañas, que alcanzan hasta los 4 metros de altura, que cumplían dos funciones principales: cultivo y contención de las erosiones producidas por las lluvias

El sector agrícola está dividido en alto y bajo. El alto presenta cinco recintos, la Apacheta ( piedra que marca un lugar sagrado), y más de cuarenta andenes. El bajo tiene siete recintos, cuatro canchones y aproximadamente 80 andenes.

La sucesión casi infinita de estas terrazas agrícolas se extienden horizontalmente en la montaña. Parecen estar conectadas en forma distinta: algunas por escaleras conformadas por piedras empotradas en los muros de contención de las terrazas a manera de peldaños o simplemente talladas en la piedra, y otras por escalinatas de múltiples gradas de piedra dispuestas a manera de corredores. El diseño de las terrazas o andenes está en perfecta armonía con el entorno que rodea el lugar, lo que le otorga aquella impresión ya mencionada de que las laderas hubieran sido esculpidas para armonizar con la naturaleza.

Se observa que los de la parte superior del camino de ingreso eran para funciones agrícolas, por ser más anchos y presentar escaleras en volado, a diferencia de los andenes inferiores que servirían para evitar las erosiones ocasionadas por las lluvias de la zona. Existe solamente un canal de agua que va hacia el sector, en el que se encuentran unas habitaciones con techo de paja que, al parecer, sirvieron como depósitos (llamados collpas en quechua).

Entre sus principales áreas se reconocen:

La Roca Funeraria: los arqueólogos encontraron restos humanos que pertenecieron a entierros realizados en el entorno. También se han encontrado piedras horadadas en la parte superior que son del lugar y que posiblemente sirvieron para ofrendas. Existe una roca ritual granítica, labrada con escalones, en cuya parte superior se puede acomodar una persona en posición cúbito dorsal.

El Puesto de Vigilancia: se encuentra antes de la portada principal y está conformada por un edificio de tres muros con ventanas, desde donde se aprecia los sectores urbano y agrícola, así como los alrededores, siendo un lugar ideal para tomar fotografías del Valle del Urubamba.